中國航空運輸協會是在民政部登記的全國性社會團體，成立于2005年9月9日，其行業主管部門為中國民用航空局，由八家航空運輸企業和一家民航院校共同發起設立，現有會員66家。2009年被民政部評為全國5A級社團組織，2010年被民政部評為全國先進社會組織。

中國航協第三屆理事會設理事長、專職副理事長、副理事長、秘書長等領導職務。秘書處設有副秘書長，職能機構設有綜合人事部、財務部、研究部、市場部、培訓部、交流部6個部門。在華北、華東、中南、西南、西北、東北和新疆分別設有代表處。分支機構有航空安全工作委員會、通用航空分會、航空運輸銷售代理人委員會、航空油料分會、飛行乘務員委員會、航空食品分會、法律委員會、收入會計工作委員會和海峽兩岸航空運輸交流委員會。

中國航協發展基本思路暨“12633”發展戰略是：堅持以中國特色社會主義理論為指導，緊密圍繞行業發展和會員需要開展工作，促進科學發展、促進持續安全，維護會員權益、維護市場秩序，強化職業培訓、強化合作交流，充分發揮引導協調、支持保證和橋梁紐帶作用，努力建設研究型、協同型、服務型社團組織，為實現建成民航強國目標貢獻力量。

中國航空集團公司原總經理、現任中國民用航空局局長李家祥和中國航空集團公司原總經理孔棟先后擔任第一屆理事會理事長，中國東方航空集團公司總經理劉紹勇任第二屆理事會理事長。全國政協委員、中國民用航空局原副局長李軍現任第三屆理事會理事長。