率先進行科技體制改革，進軍國民經濟主戰場

20?世紀?80—90?年代，在逐步建立社會主義市場經濟和推進科技體制改革的新形勢下，中國科學院順應時代要求，在科研組織管理、撥款制度以及人事制度等方面進行了一系列改革和探索，走在了全國科技體制改革的前列，充分發揮了國家科研機構在科技體制改革中的先行者和示范帶動作用。如，率先設立面向全國的科學基金，實行研究所所長負責制，建立開放實驗室制度；在學部制度基礎上建立了院士制度，啟動了“百人計劃”；改革和調整研究所，確立了全員聘用合同制；促進學術交流，與科技部共同設立“香山科學會議”等。

這一時期，國家科技工作的指導方針強調“科學技術是第一生產力”，“經濟建設必須依靠科學技術，科學技術必須面向經濟建設”，要“促使經濟建設轉移到依靠科技進步和提高勞動者素質上來，努力攀登科技發展的新高峰”。面對國家建立社會主義市場經濟體制的需要，中國科學院不斷重新定位，于?1978?年、1984?年、1987?年先后?3?次調整辦院方針，1987?年將辦院方針確定為“把主要力量動員和組織到為國民經濟和社會發展服務的主戰場，同時保持一支精干力量從事基礎研究和高技術跟蹤”（1992?年將“跟蹤”改為“創新”）。

在此期間，科技開發工作逐漸成為中國科學院科技工作的重要組成部分，探索實施“一院兩種運行機制”，組織了近萬名科技人員從事科技開發工作，一大批“科”字頭的高技術企業由中國科學院研究所脫胎而出，特別是在計算機等信息技術領域，迅速帶動了我國相關產業鏈的發展，形成了以“中關村電子一條街”為代表的特色區域經濟，其后興起全國范圍的科技開發區建設。其中，聯想公司逐漸發展成為我國?IT?產業的龍頭企業之一，而“中關村”則至今仍是我國體制機制創新的試驗田和中國創新發展的一面旗幟。

雖然進行科技體制機制改革和進軍國民經濟主戰場，但基礎科學研究一直是中國科學院科研工作的主要任務之一。在國家自然科學基礎研究方面，中國科學院起著主導作用，取得了一批具有國際影響的研究成果。如吳文俊提出了用計算機證明幾何定理的“吳方法”與方程求解的“吳消元法”，為信息時代數學發展開辟了新途徑；黃昆團隊的超晶格光學聲子模理論，被譽為“黃-朱模型”；劉東生確立了黃土“新風成學說”，成為研究全球環境演變的重大轉折，使黃土成為地球環境變化研究的三大支柱之一；澄江古生物群的發現和研究，為寒武紀大爆發假說提供了有力證據……。與此同時，在資源環境、生物醫藥、農業、信息技術、新材料研制和空間技術等方面也取得了一系列科研成果，為我國經濟發展和社會公益事業作出了重要貢獻。